Metaviromics in water bodies: past, present and future perspectives

Marcos López-Pérez, 0000-0002-5297-6596

Metaviromics in water bodies: past, present and future perspectives Metavirómica en masas de agua: pasado, presente y perspectivas futuras

dc.audience	researchers	es_MX
dc.contributor.author	Marcos López-Pérez, 0000-0002-5297-6596
dc.contributor.other	Fernández, Francisco José
dc.coverage	MX	es_MX
dc.date.accessioned	2018-05-31T01:30:48Z
dc.date.available	2018-05-31T01:30:48Z
dc.date.issued	2013
dc.description	Los virus son los microorganismos más abundantes en la biosfera. Debido a su gran versatilidad para infectar a todo tipo de organismos y a su condición de parásitos intracelulares obligados, tienen efectos muy importantes en la dinámica de los ecosistemas. La identificación y análisis de las interacciones en las comunidades víricas es un trabajo complicado, debido a la dificultad intrínseca en el cultivo de estos microorganismos. Además, la carencia de secuencias de ADN conservadas entre grupos imposibilita su identificación con una tecnología del tipo ADNr, la común en la actualidad para la identificación de los organismos vivos. La metagenómica surge como una alternativa para la caracterización molecular de los virus en sus ambientes naturales, una alternativa que arroja información relevante en cuanto a la composición y estructura en dicho ambiente. En este artículo de revisión se hace un repaso del papel de los virus en los ecosistemas acuáticos, además de enfatizar en la importancia de una adecuada implementación de las técnicas de metagenómica. Finalmente, se revisan las principales herramientas informáticas para el tratamiento de los datos metagenómicos obtenidos.	es_MX
dc.description	Viruses are the most abundant organisms in the biosphere. Because of their versatility to infect all types of organisms and their status as obligate intracellular parasites, they have important effects on ecosystem dynamics. Identification and analysis of interactions in viral communities is a hard work, due to the inherent difficulty in culturing these microorganisms. Furthermore, the lack of conserved DNA sequences among groups precludes identification of the viruses by using rDNA technology, as the current molecular standard for the identification of living organisms. Metagenomics arises as an alternative to the molecular characterization of the virus in its natural environments, which yields information relevant to its composition and structure. In this article, we review the role of viruses in aquatic ecosystems, in addition to emphasizing the importance of proper implementation of these metagenomic techniques. Finally, we review the main tools for the treatment of the obtained metagenomic data.	es_MX
dc.format	application/pdf	es_MX
dc.identificador.materia	2	es_MX
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/20.500.12222/48
dc.language	spa	es_MX
dc.publisher	Universidad Autónoma Metropolitana. Unidad Iztapalapa	es_MX
dc.rights	Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional	*
dc.rights.license	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_MX
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	es_MX
dc.source.other	Hidrobiológica (3) vol.23 (2013)	es_MX
dc.source.other	ISSN: 0188-8897	es_MX
dc.subject	BIOLOGÍA Y QUÍMICA	es_MX
dc.subject.keywords	Acervo genético	es_MX
dc.subject.keywords	Metagenomas víricos	es_MX
dc.subject.keywords	Papel ecológico	es_MX
dc.subject.keywords	Virus acuáticos	es_MX
dc.subject.keywords	Genetic stock	es_MX
dc.subject.keywords	Metaviromics	es_MX
dc.subject.keywords	Ecological role	es_MX
dc.subject.keywords	Aquatic viruses	es_MX
dc.title	Metaviromics in water bodies: past, present and future perspectives
dc.title	Metavirómica en masas de agua: pasado, presente y perspectivas futuras	es_MX
dc.type	article	es_MX
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/publishedVersion	es_MX